Yuhai Tuの論文を読み解く-04
・式 [4]の下,p.14856,左段落,上から六行目
ここには,
\( \Large \displaystyle C \equiv \frac{K_I}{K_A} < 1\)
\( \Large \displaystyle L \rightarrow \infty, \hspace{ 20pt } f_L(L) \rightarrow -ln \ C \)
とさりげなく書かれています,これを導き出しましょう.
エネルギー状態は,
ここでは,
P(0,0) : 不活性, リガンド未結合
P(0,1) : 不活性, リガンド結合
P(0,0) : 活性, リガンド未結合
P(0,0) : 活性, リガンド結合
の4状態を考えます.
・Cの定義
\( \Large \displaystyle \frac{P(0,1)}{P(0,1)} = \frac{L}{K_i} \rightarrow \Delta E_i = ln \frac{L}{K_i} \)
\( \Large \displaystyle \frac{P(1,1)}{P(1,1)} = \frac{L}{K_a} \rightarrow \Delta E_a = ln \frac{L}{K_a} \)\
となるので,
\( \Large \displaystyle \frac{K_i}{K_a} = \frac{\Delta E_a}{\Delta E_i} \)
となります.上の図で設定したように,
\( \Large \displaystyle \Delta E_a < \Delta E_i \) なので,
\( \Large \displaystyle C \equiv \frac{K_i}{K_a} < 1 \)
となります.
・リガンド濃度が無限大の場合
\( \Large \displaystyle f_L (L) = ln \frac{ 1 + \frac{L}{K_i}}{ 1 + \frac{L}{K_a}} = ln \frac{ \frac{1}{L} + \frac{1}{K_i}}{ \frac{1}{L} + \frac{1}{K_a}} \)
です(分子・分母をLで割った)
L→無限大だと,
\( \Large \displaystyle f_L ( \infty ) = ln \frac{ \frac{1}{ \infty} + \frac{1}{K_i}}{ \frac{1}{ \infty} + \frac{1}{K_a}} = ln \frac{K_a }{K_i} = - ln \ C \)
・なぜ,\( \Large \displaystyle \Delta E_a < \Delta E_i \),なのか
なぜ,彼らがこのような状態を考えたのか,推論していきましょう.
もし,C>1,だとしたらどうなるのでしょう?
リガンドが無限大の場合,
\( \Large \displaystyle f_L ( \infty ) = - ln \ C < 0 \)
となり,マイナスの値となります.ということは,
リガンドが飽和的に結合すると,エネルギー準位が逆転する,ということになるのでしょうか?
なので,C<1,と考えているのだと思います(多分です....)